Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CENPEQ02224 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPEQ02224 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms