Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD3P62318 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD3P62318 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD3P62318 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD3P62318 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD3P62318 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD3P62318 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD3P62318 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD3P62318 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD3P62318 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD3P62318 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD3P62318 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD3P62318 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD3P62318 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD3P62318 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD3P62318 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD3P62318 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPD3P62318 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPD3P62318 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD3P62318 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms