Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPS2P61201 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPS2P61201 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPS2P61201 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPS2P61201 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COPS2P61201 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPS2P61201 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPS2P61201 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COPS2P61201 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPS2P61201 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS2P61201 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS2P61201 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS2P61201 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS2P61201 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS2P61201 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS2P61201 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS2P61201 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS2P61201 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS2P61201 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS2P61201 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS2P61201 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS2P61201 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS2P61201 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS2P61201 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS2P61201 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS2P61201 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS2P61201 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS2P61201 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS2P61201 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS2P61201 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS2P61201 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS2P61201 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS2P61201 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS2P61201 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS2P61201 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS2P61201 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS2P61201 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS2P61201 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPS2P61201 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPS2P61201 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS2P61201 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS2P61201 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS2P61201 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS2P61201 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS2P61201 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS2P61201 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
COPS2P61201 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COPS2P61201 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPS2P61201 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPS2P61201 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COPS2P61201 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPS2P61201 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPS2P61201 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPS2P61201 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPS2P61201 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPS2P61201 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPS2P61201 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPS2P61201 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPS2P61201 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPS2P61201 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPS2P61201 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPS2P61201 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPS2P61201 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPS2P61201 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPS2P61201 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPS2P61201 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPS2P61201 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPS2P61201 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPS2P61201 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COPS2P61201 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPS2P61201 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COPS2P61201 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPS2P61201 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPS2P61201 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS2P61201 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS2P61201 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS2P61201 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS2P61201 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS2P61201 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS2P61201 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS2P61201 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS2P61201 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS2P61201 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS2P61201 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS2P61201 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS2P61201 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPS2P61201 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPS2P61201 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
COPS2P61201 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPS2P61201 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS2P61201 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS2P61201 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS2P61201 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS2P61201 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS2P61201 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS2P61201 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS2P61201 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS2P61201 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS2P61201 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS2P61201 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms