Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN1P60606 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms