Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GEMIN4P57678 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
GEMIN4P57678 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GEMIN4P57678 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GEMIN4P57678 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GEMIN4P57678 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GEMIN4P57678 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GEMIN4P57678 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GEMIN4P57678 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms