Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RP1P56715 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RP1P56715 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RP1P56715 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RP1P56715 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RP1P56715 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RP1P56715 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RP1P56715 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RP1P56715 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RP1P56715 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RP1P56715 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RP1P56715 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RP1P56715 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RP1P56715 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RP1P56715 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RP1P56715 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RP1P56715 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RP1P56715 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RP1P56715 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RP1P56715 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RP1P56715 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RP1P56715 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RP1P56715 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RP1P56715 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RP1P56715 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RP1P56715 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RP1P56715 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RP1P56715 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RP1P56715 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RP1P56715 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RP1P56715 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RP1P56715 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RP1P56715 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RP1P56715 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RP1P56715 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RP1P56715 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RP1P56715 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RP1P56715 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RP1P56715 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RP1P56715 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RP1P56715 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RP1P56715 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RP1P56715 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RP1P56715 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RP1P56715 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RP1P56715 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RP1P56715 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RP1P56715 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RP1P56715 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RP1P56715 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RP1P56715 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RP1P56715 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RP1P56715 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RP1P56715 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RP1P56715 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RP1P56715 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RP1P56715 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RP1P56715 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RP1P56715 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RP1P56715 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RP1P56715 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RP1P56715 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RP1P56715 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RP1P56715 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RP1P56715 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RP1P56715 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RP1P56715 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RP1P56715 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RP1P56715 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RP1P56715 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RP1P56715 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RP1P56715 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RP1P56715 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RP1P56715 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RP1P56715 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RP1P56715 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RP1P56715 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RP1P56715 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RP1P56715 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RP1P56715 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RP1P56715 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RP1P56715 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RP1P56715 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RP1P56715 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RP1P56715 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RP1P56715 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RP1P56715 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RP1P56715 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RP1P56715 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RP1P56715 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RP1P56715 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RP1P56715 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RP1P56715 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RP1P56715 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RP1P56715 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RP1P56715 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RP1P56715 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RP1P56715 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RP1P56715 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RP1P56715 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms