Protein–RNA interactions for Protein: P56645

PER3, Period circadian protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER3P56645 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PER3P56645 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PER3P56645 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PER3P56645 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PER3P56645 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PER3P56645 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PER3P56645 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PER3P56645 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PER3P56645 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PER3P56645 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PER3P56645 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PER3P56645 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PER3P56645 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PER3P56645 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PER3P56645 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PER3P56645 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PER3P56645 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PER3P56645 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PER3P56645 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PER3P56645 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PER3P56645 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PER3P56645 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PER3P56645 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PER3P56645 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PER3P56645 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PER3P56645 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PER3P56645 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PER3P56645 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PER3P56645 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PER3P56645 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PER3P56645 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PER3P56645 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PER3P56645 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PER3P56645 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PER3P56645 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PER3P56645 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PER3P56645 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PER3P56645 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PER3P56645 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PER3P56645 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PER3P56645 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PER3P56645 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PER3P56645 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PER3P56645 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PER3P56645 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PER3P56645 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PER3P56645 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PER3P56645 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PER3P56645 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PER3P56645 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PER3P56645 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PER3P56645 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PER3P56645 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PER3P56645 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PER3P56645 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PER3P56645 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PER3P56645 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PER3P56645 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PER3P56645 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PER3P56645 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PER3P56645 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PER3P56645 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PER3P56645 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PER3P56645 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PER3P56645 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PER3P56645 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PER3P56645 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PER3P56645 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PER3P56645 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PER3P56645 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PER3P56645 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PER3P56645 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PER3P56645 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PER3P56645 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PER3P56645 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PER3P56645 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PER3P56645 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PER3P56645 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PER3P56645 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PER3P56645 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PER3P56645 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PER3P56645 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PER3P56645 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PER3P56645 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PER3P56645 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PER3P56645 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PER3P56645 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PER3P56645 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PER3P56645 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PER3P56645 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PER3P56645 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PER3P56645 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PER3P56645 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PER3P56645 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PER3P56645 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PER3P56645 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PER3P56645 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PER3P56645 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PER3P56645 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PER3P56645 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms