Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L1P55209 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L1P55209 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms