Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLTPP55058 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLTPP55058 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLTPP55058 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLTPP55058 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PLTPP55058 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLTPP55058 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLTPP55058 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLTPP55058 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLTPP55058 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLTPP55058 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLTPP55058 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLTPP55058 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLTPP55058 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLTPP55058 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLTPP55058 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLTPP55058 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLTPP55058 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLTPP55058 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLTPP55058 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLTPP55058 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PLTPP55058 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLTPP55058 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLTPP55058 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PLTPP55058 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLTPP55058 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLTPP55058 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLTPP55058 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLTPP55058 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PLTPP55058 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLTPP55058 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLTPP55058 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLTPP55058 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLTPP55058 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLTPP55058 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLTPP55058 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLTPP55058 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLTPP55058 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLTPP55058 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PLTPP55058 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PLTPP55058 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLTPP55058 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLTPP55058 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLTPP55058 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLTPP55058 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLTPP55058 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLTPP55058 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLTPP55058 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLTPP55058 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLTPP55058 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLTPP55058 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLTPP55058 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLTPP55058 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLTPP55058 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLTPP55058 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLTPP55058 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLTPP55058 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLTPP55058 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLTPP55058 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLTPP55058 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLTPP55058 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLTPP55058 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLTPP55058 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLTPP55058 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLTPP55058 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLTPP55058 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLTPP55058 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLTPP55058 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLTPP55058 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLTPP55058 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLTPP55058 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLTPP55058 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PLTPP55058 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLTPP55058 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLTPP55058 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLTPP55058 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLTPP55058 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLTPP55058 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLTPP55058 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLTPP55058 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLTPP55058 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLTPP55058 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLTPP55058 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLTPP55058 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLTPP55058 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLTPP55058 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLTPP55058 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLTPP55058 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLTPP55058 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLTPP55058 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLTPP55058 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLTPP55058 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLTPP55058 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PLTPP55058 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PLTPP55058 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PLTPP55058 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLTPP55058 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLTPP55058 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLTPP55058 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLTPP55058 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms