Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN1P54253 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATXN1P54253 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATXN1P54253 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms