Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IST1P53990 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IST1P53990 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IST1P53990 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IST1P53990 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IST1P53990 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IST1P53990 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IST1P53990 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IST1P53990 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IST1P53990 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IST1P53990 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IST1P53990 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IST1P53990 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IST1P53990 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IST1P53990 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IST1P53990 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IST1P53990 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IST1P53990 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IST1P53990 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IST1P53990 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IST1P53990 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IST1P53990 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IST1P53990 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IST1P53990 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IST1P53990 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IST1P53990 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IST1P53990 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IST1P53990 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IST1P53990 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IST1P53990 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IST1P53990 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IST1P53990 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IST1P53990 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IST1P53990 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IST1P53990 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IST1P53990 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IST1P53990 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
IST1P53990 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IST1P53990 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IST1P53990 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IST1P53990 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IST1P53990 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IST1P53990 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IST1P53990 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IST1P53990 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IST1P53990 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IST1P53990 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IST1P53990 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IST1P53990 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IST1P53990 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IST1P53990 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IST1P53990 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IST1P53990 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IST1P53990 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IST1P53990 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IST1P53990 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IST1P53990 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IST1P53990 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IST1P53990 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IST1P53990 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IST1P53990 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IST1P53990 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IST1P53990 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IST1P53990 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IST1P53990 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IST1P53990 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IST1P53990 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IST1P53990 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IST1P53990 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IST1P53990 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IST1P53990 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IST1P53990 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IST1P53990 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IST1P53990 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IST1P53990 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IST1P53990 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IST1P53990 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IST1P53990 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IST1P53990 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IST1P53990 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IST1P53990 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IST1P53990 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IST1P53990 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IST1P53990 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IST1P53990 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IST1P53990 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IST1P53990 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IST1P53990 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IST1P53990 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IST1P53990 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IST1P53990 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IST1P53990 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IST1P53990 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IST1P53990 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IST1P53990 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IST1P53990 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IST1P53990 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IST1P53990 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IST1P53990 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IST1P53990 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms