Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MVDP53602 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MVDP53602 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MVDP53602 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MVDP53602 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MVDP53602 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MVDP53602 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MVDP53602 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MVDP53602 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MVDP53602 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MVDP53602 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MVDP53602 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MVDP53602 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MVDP53602 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MVDP53602 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MVDP53602 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MVDP53602 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MVDP53602 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MVDP53602 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MVDP53602 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MVDP53602 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MVDP53602 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MVDP53602 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MVDP53602 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MVDP53602 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
MVDP53602 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MVDP53602 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MVDP53602 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MVDP53602 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MVDP53602 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MVDP53602 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MVDP53602 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MVDP53602 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MVDP53602 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MVDP53602 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MVDP53602 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MVDP53602 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MVDP53602 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MVDP53602 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MVDP53602 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MVDP53602 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MVDP53602 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MVDP53602 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MVDP53602 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MVDP53602 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MVDP53602 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MVDP53602 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MVDP53602 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MVDP53602 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MVDP53602 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MVDP53602 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MVDP53602 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MVDP53602 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MVDP53602 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MVDP53602 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MVDP53602 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MVDP53602 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MVDP53602 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MVDP53602 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MVDP53602 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MVDP53602 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MVDP53602 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MVDP53602 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MVDP53602 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MVDP53602 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MVDP53602 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MVDP53602 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MVDP53602 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MVDP53602 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MVDP53602 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MVDP53602 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MVDP53602 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MVDP53602 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MVDP53602 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MVDP53602 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MVDP53602 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MVDP53602 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MVDP53602 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MVDP53602 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MVDP53602 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MVDP53602 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MVDP53602 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MVDP53602 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MVDP53602 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MVDP53602 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MVDP53602 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MVDP53602 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MVDP53602 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MVDP53602 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MVDP53602 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MVDP53602 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MVDP53602 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MVDP53602 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MVDP53602 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MVDP53602 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MVDP53602 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MVDP53602 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MVDP53602 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MVDP53602 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MVDP53602 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms