Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THOP1P52888 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THOP1P52888 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
THOP1P52888 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THOP1P52888 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THOP1P52888 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THOP1P52888 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THOP1P52888 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THOP1P52888 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THOP1P52888 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THOP1P52888 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THOP1P52888 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THOP1P52888 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THOP1P52888 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THOP1P52888 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THOP1P52888 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THOP1P52888 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THOP1P52888 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THOP1P52888 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THOP1P52888 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THOP1P52888 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THOP1P52888 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THOP1P52888 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THOP1P52888 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THOP1P52888 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THOP1P52888 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
THOP1P52888 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THOP1P52888 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
THOP1P52888 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THOP1P52888 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THOP1P52888 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THOP1P52888 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THOP1P52888 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THOP1P52888 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THOP1P52888 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THOP1P52888 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
THOP1P52888 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THOP1P52888 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THOP1P52888 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THOP1P52888 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THOP1P52888 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THOP1P52888 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THOP1P52888 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THOP1P52888 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THOP1P52888 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THOP1P52888 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THOP1P52888 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THOP1P52888 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THOP1P52888 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
THOP1P52888 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THOP1P52888 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THOP1P52888 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THOP1P52888 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THOP1P52888 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THOP1P52888 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THOP1P52888 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THOP1P52888 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THOP1P52888 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THOP1P52888 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THOP1P52888 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THOP1P52888 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THOP1P52888 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THOP1P52888 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THOP1P52888 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THOP1P52888 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THOP1P52888 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THOP1P52888 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THOP1P52888 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
THOP1P52888 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THOP1P52888 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THOP1P52888 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THOP1P52888 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THOP1P52888 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THOP1P52888 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THOP1P52888 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THOP1P52888 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THOP1P52888 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
THOP1P52888 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THOP1P52888 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THOP1P52888 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THOP1P52888 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THOP1P52888 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THOP1P52888 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THOP1P52888 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THOP1P52888 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THOP1P52888 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THOP1P52888 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THOP1P52888 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THOP1P52888 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THOP1P52888 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THOP1P52888 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THOP1P52888 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THOP1P52888 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THOP1P52888 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THOP1P52888 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THOP1P52888 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THOP1P52888 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THOP1P52888 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THOP1P52888 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THOP1P52888 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms