Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF138P52744 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF138P52744 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF138P52744 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF138P52744 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF138P52744 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF138P52744 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF138P52744 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms