Protein–RNA interactions for Protein: P51946

CCNH, Cyclin-H, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNHP51946 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNHP51946 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNHP51946 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNHP51946 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNHP51946 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNHP51946 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNHP51946 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNHP51946 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNHP51946 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNHP51946 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNHP51946 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNHP51946 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNHP51946 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNHP51946 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNHP51946 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNHP51946 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNHP51946 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNHP51946 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNHP51946 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNHP51946 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNHP51946 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNHP51946 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNHP51946 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNHP51946 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNHP51946 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNHP51946 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNHP51946 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNHP51946 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNHP51946 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNHP51946 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNHP51946 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNHP51946 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNHP51946 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNHP51946 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNHP51946 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNHP51946 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNHP51946 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNHP51946 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNHP51946 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNHP51946 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNHP51946 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNHP51946 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNHP51946 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNHP51946 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNHP51946 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNHP51946 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNHP51946 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNHP51946 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNHP51946 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNHP51946 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNHP51946 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNHP51946 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNHP51946 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNHP51946 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNHP51946 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNHP51946 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNHP51946 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNHP51946 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNHP51946 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNHP51946 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNHP51946 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNHP51946 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNHP51946 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNHP51946 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNHP51946 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNHP51946 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNHP51946 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNHP51946 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNHP51946 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNHP51946 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNHP51946 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNHP51946 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNHP51946 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNHP51946 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNHP51946 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNHP51946 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNHP51946 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNHP51946 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNHP51946 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNHP51946 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNHP51946 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNHP51946 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNHP51946 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNHP51946 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNHP51946 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNHP51946 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNHP51946 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNHP51946 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNHP51946 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNHP51946 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNHP51946 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNHP51946 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNHP51946 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNHP51946 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNHP51946 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNHP51946 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNHP51946 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNHP51946 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNHP51946 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNHP51946 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms