Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LUMP51884 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LUMP51884 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LUMP51884 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LUMP51884 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LUMP51884 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LUMP51884 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LUMP51884 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LUMP51884 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LUMP51884 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LUMP51884 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LUMP51884 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LUMP51884 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LUMP51884 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LUMP51884 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LUMP51884 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LUMP51884 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LUMP51884 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LUMP51884 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LUMP51884 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LUMP51884 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LUMP51884 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LUMP51884 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LUMP51884 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LUMP51884 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LUMP51884 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LUMP51884 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LUMP51884 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LUMP51884 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LUMP51884 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LUMP51884 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LUMP51884 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LUMP51884 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LUMP51884 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LUMP51884 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LUMP51884 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LUMP51884 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LUMP51884 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LUMP51884 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LUMP51884 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LUMP51884 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LUMP51884 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LUMP51884 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LUMP51884 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LUMP51884 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LUMP51884 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LUMP51884 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LUMP51884 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LUMP51884 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LUMP51884 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LUMP51884 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LUMP51884 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LUMP51884 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LUMP51884 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LUMP51884 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LUMP51884 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LUMP51884 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LUMP51884 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LUMP51884 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LUMP51884 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LUMP51884 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LUMP51884 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LUMP51884 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LUMP51884 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LUMP51884 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LUMP51884 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LUMP51884 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LUMP51884 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LUMP51884 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LUMP51884 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LUMP51884 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LUMP51884 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LUMP51884 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LUMP51884 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LUMP51884 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LUMP51884 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LUMP51884 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LUMP51884 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LUMP51884 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LUMP51884 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LUMP51884 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LUMP51884 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LUMP51884 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LUMP51884 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LUMP51884 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LUMP51884 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LUMP51884 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LUMP51884 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LUMP51884 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LUMP51884 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LUMP51884 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LUMP51884 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LUMP51884 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LUMP51884 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LUMP51884 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LUMP51884 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LUMP51884 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LUMP51884 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LUMP51884 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LUMP51884 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms