Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RORCP51449 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RORCP51449 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RORCP51449 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RORCP51449 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORCP51449 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORCP51449 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RORCP51449 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORCP51449 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORCP51449 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORCP51449 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORCP51449 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORCP51449 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORCP51449 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORCP51449 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORCP51449 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORCP51449 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RORCP51449 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RORCP51449 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RORCP51449 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RORCP51449 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RORCP51449 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RORCP51449 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RORCP51449 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RORCP51449 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RORCP51449 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RORCP51449 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RORCP51449 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RORCP51449 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RORCP51449 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RORCP51449 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RORCP51449 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RORCP51449 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RORCP51449 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RORCP51449 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RORCP51449 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RORCP51449 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RORCP51449 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RORCP51449 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RORCP51449 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RORCP51449 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RORCP51449 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RORCP51449 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RORCP51449 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RORCP51449 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RORCP51449 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORCP51449 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORCP51449 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORCP51449 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORCP51449 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORCP51449 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORCP51449 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORCP51449 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORCP51449 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORCP51449 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORCP51449 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORCP51449 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORCP51449 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORCP51449 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORCP51449 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORCP51449 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORCP51449 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORCP51449 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORCP51449 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORCP51449 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORCP51449 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORCP51449 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORCP51449 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORCP51449 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORCP51449 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORCP51449 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORCP51449 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORCP51449 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORCP51449 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RORCP51449 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RORCP51449 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RORCP51449 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RORCP51449 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORCP51449 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RORCP51449 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORCP51449 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORCP51449 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORCP51449 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RORCP51449 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORCP51449 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORCP51449 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORCP51449 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORCP51449 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORCP51449 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORCP51449 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORCP51449 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORCP51449 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORCP51449 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORCP51449 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORCP51449 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORCP51449 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORCP51449 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORCP51449 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORCP51449 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORCP51449 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms