Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6CP51160 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6CP51160 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms