Protein–RNA interactions for Protein: P50591

TNFSF10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF10P50591 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF10P50591 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF10P50591 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFSF10P50591 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF10P50591 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms