Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms