Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 POMGNT1-203ENST00000396420 3480 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.449e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 ZNF611-211ENST00000598639 738 ntTSL 312.15□□□□□ -0.469e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.489e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 GGA1-222ENST00000489772 1384 ntTSL 211.99□□□□□ -0.499e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 TBCD-206ENST00000571712 850 ntTSL 511.93□□□□□ -0.59e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 EHBP1-220ENST00000496857 1262 ntTSL 1 (best)11.87□□□□□ -0.519e-7■■■■■ 61.1
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AARSP49588 GALE-214ENST00000481736 1801 ntTSL 211.74□□□□□ -0.539e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 GON4L-202ENST00000361040 5118 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.549e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 OOEP-203ENST00000441145 964 ntTSL 311.38□□□□□ -0.599e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 FNBP1-204ENST00000446176 5393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.599e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 ZNF611-207ENST00000596702 538 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.659e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 GTF2IRD1-204ENST00000470715 824 ntTSL 310.88□□□□□ -0.674e-6■■■■■ 61.1
AARSP49588 TBCD-219ENST00000576160 942 ntTSL 510.84□□□□□ -0.679e-7■■■■■ 61.1
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AARSP49588 ZNF611-219ENST00000602162 3299 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.779e-7■■■■■ 61.1
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AARSP49588 TMEM87A-203ENST00000448392 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.89e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 ABCF2-202ENST00000287844 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.819e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 ZNF611-210ENST00000597566 509 ntTSL 49.78□□□□□ -0.849e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 RPS2-214ENST00000533186 625 ntTSL 39.68□□□□□ -0.869e-7■■■■■ 61.1
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AARSP49588 CNIH4-205ENST00000465271 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.869e-7■■■■■ 61.1
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AARSP49588 TMEM87A-205ENST00000562946 1430 ntTSL 29.53□□□□□ -0.889e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 TMEM87A-202ENST00000389834 3109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.899e-7■■■■■ 61.1
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AARSP49588 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.939e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.949e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 ZNF611-220ENST00000640952 577 ntTSL 49.05□□□□□ -0.969e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 ZNF611-203ENST00000540744 4417 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.969e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 ZNF611-214ENST00000600943 560 ntTSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.969e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.969e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.999e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 ENTPD5-201ENST00000334696 5842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.029e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 COPS2-207ENST00000560240 514 ntTSL 48.63□□□□□ -1.039e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 ZNF611-205ENST00000595001 4796 ntTSL 1 (best)8.52□□□□□ -1.059e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.51□□□□□ -1.059e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 SSBP3-211ENST00000528787 577 ntTSL 48.5□□□□□ -1.059e-7■■■■■ 61.1
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AARSP49588 ZNF611-213ENST00000599798 302 ntTSL 58.45□□□□□ -1.069e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.069e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.099e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.129e-7■■■■■ 61.1
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AARSP49588 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.169e-7■■■■■ 61.1
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AARSP49588 CEP85-204ENST00000468163 453 ntTSL 27.16□□□□□ -1.269e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.289e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 SSBP3-207ENST00000426150 851 ntTSL 36.87□□□□□ -1.319e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 ZNF611-212ENST00000598723 565 ntTSL 46.84□□□□□ -1.319e-7■■■■■ 61.1
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AARSP49588 GON4L-208ENST00000468867 471 ntTSL 36.35□□□□□ -1.399e-7■■■■■ 61.1
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AARSP49588 EHBP1-218ENST00000491965 584 ntTSL 24.12□□□□□ -1.759e-7■■■■■ 61.1
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AARSP49588 TMEM87A-209ENST00000566474 581 ntTSL 43.84□□□□□ -1.799e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 RPS2-217ENST00000563194 170 ntTSL 53.26□□□□□ -1.899e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 CEP83-214ENST00000552632 705 ntTSL 33.12□□□□□ -1.919e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.979e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 CHD9-204ENST00000561869 720 ntTSL 22.47□□□□□ -2.019e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 TVP23C-CDRT4-202ENST00000518506 520 ntTSL 52.04□□□□□ -2.089e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 TMEM87A-204ENST00000561578 528 ntTSL 41.58□□□□□ -2.169e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.781e-323■■■■■ 61
AARSP49588 RAP1GAP-202ENST00000317967 600 ntTSL 216.68■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 60.5
AARSP49588 RAP1GAP-213ENST00000611549 4294 ntTSL 513.97□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 60.5
AARSP49588 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 60.5
AARSP49588 RAP1GAP-206ENST00000374765 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 60.5
AARSP49588 RAP1GAP-212ENST00000542643 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 60.5
AARSP49588 RAP1GAP-208ENST00000464457 409 ntTSL 39.11□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 60.5
AARSP49588 RAP1GAP-210ENST00000482984 331 ntTSL 56.43□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 60.5
AARSP49588 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 59.5
AARSP49588 PPP6R1-208ENST00000592242 574 ntTSL 412.55□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 59.5
AARSP49588 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.358e-9■■■■■ 59.2
AARSP49588 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.048e-9■■■■■ 59.2
AARSP49588 FAM120B-201ENST00000476287 5155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.918e-9■■■■■ 59.2
AARSP49588 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.948e-9■■■■■ 59.2
AARSP49588 DSCR4-202ENST00000398948 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 59
AARSP49588 SPTBN2-207ENST00000532650 571 ntTSL 212.65□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 58.9
AARSP49588 LRRC29-203ENST00000409509 1410 ntTSL 1 (best)23.17■■□□□ 1.31e-6■■■■■ 58.4
AARSP49588 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 58.4
AARSP49588 LRRC29-202ENST00000409037 1707 ntTSL 520.68■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 58.4
AARSP49588 LRRC29-204ENST00000424285 785 ntTSL 320.55■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 58.4
AARSP49588 LRRC29-208ENST00000485549 537 ntTSL 420.23■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 58.4
AARSP49588 LRRC29-212ENST00000637894 1116 ntTSL 519.99■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 58.4
AARSP49588 LRRC29-205ENST00000433915 786 ntTSL 519.66■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 58.4
AARSP49588 LRRC29-206ENST00000447579 941 ntTSL 319.5■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 58.4
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