Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX1P48742 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX1P48742 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX1P48742 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX1P48742 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX1P48742 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX1P48742 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX1P48742 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX1P48742 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX1P48742 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX1P48742 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX1P48742 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX1P48742 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX1P48742 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX1P48742 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX1P48742 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX1P48742 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX1P48742 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LHX1P48742 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LHX1P48742 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LHX1P48742 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LHX1P48742 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LHX1P48742 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LHX1P48742 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LHX1P48742 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LHX1P48742 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LHX1P48742 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LHX1P48742 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX1P48742 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX1P48742 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX1P48742 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX1P48742 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX1P48742 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX1P48742 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX1P48742 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX1P48742 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX1P48742 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX1P48742 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX1P48742 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LHX1P48742 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LHX1P48742 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LHX1P48742 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LHX1P48742 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LHX1P48742 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LHX1P48742 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX1P48742 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX1P48742 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX1P48742 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX1P48742 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX1P48742 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX1P48742 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX1P48742 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX1P48742 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX1P48742 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX1P48742 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX1P48742 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX1P48742 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX1P48742 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX1P48742 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX1P48742 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX1P48742 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX1P48742 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX1P48742 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LHX1P48742 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LHX1P48742 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LHX1P48742 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LHX1P48742 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LHX1P48742 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LHX1P48742 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LHX1P48742 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LHX1P48742 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LHX1P48742 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LHX1P48742 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LHX1P48742 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX1P48742 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX1P48742 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX1P48742 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX1P48742 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX1P48742 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX1P48742 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX1P48742 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX1P48742 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX1P48742 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX1P48742 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX1P48742 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX1P48742 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX1P48742 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX1P48742 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX1P48742 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX1P48742 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LHX1P48742 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LHX1P48742 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LHX1P48742 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LHX1P48742 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LHX1P48742 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LHX1P48742 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LHX1P48742 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LHX1P48742 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LHX1P48742 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LHX1P48742 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms