Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMUP48645 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMUP48645 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMUP48645 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMUP48645 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMUP48645 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMUP48645 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NMUP48645 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMUP48645 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMUP48645 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMUP48645 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMUP48645 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMUP48645 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMUP48645 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMUP48645 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMUP48645 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMUP48645 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMUP48645 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMUP48645 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMUP48645 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMUP48645 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMUP48645 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMUP48645 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NMUP48645 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMUP48645 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMUP48645 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMUP48645 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMUP48645 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMUP48645 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMUP48645 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMUP48645 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMUP48645 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMUP48645 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMUP48645 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMUP48645 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMUP48645 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMUP48645 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMUP48645 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMUP48645 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMUP48645 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMUP48645 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMUP48645 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMUP48645 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMUP48645 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMUP48645 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMUP48645 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMUP48645 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMUP48645 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMUP48645 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMUP48645 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMUP48645 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMUP48645 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMUP48645 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMUP48645 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMUP48645 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMUP48645 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMUP48645 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMUP48645 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMUP48645 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMUP48645 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMUP48645 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMUP48645 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMUP48645 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMUP48645 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMUP48645 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMUP48645 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMUP48645 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMUP48645 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMUP48645 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMUP48645 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMUP48645 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMUP48645 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMUP48645 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMUP48645 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMUP48645 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NMUP48645 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NMUP48645 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NMUP48645 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMUP48645 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NMUP48645 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMUP48645 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMUP48645 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMUP48645 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMUP48645 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMUP48645 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMUP48645 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMUP48645 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NMUP48645 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMUP48645 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMUP48645 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMUP48645 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMUP48645 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMUP48645 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMUP48645 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMUP48645 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMUP48645 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMUP48645 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NMUP48645 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NMUP48645 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMUP48645 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms