Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAGEA3P43357 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAGEA3P43357 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms