Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGFRP43088 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms