Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL5P42830 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL5P42830 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms