Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CBP42338 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CBP42338 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms