Protein–RNA interactions for Protein: P41279

MAP3K8, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K8P41279 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP3K8P41279 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP3K8P41279 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP3K8P41279 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP3K8P41279 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP3K8P41279 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K8P41279 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K8P41279 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K8P41279 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K8P41279 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K8P41279 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K8P41279 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K8P41279 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K8P41279 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K8P41279 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K8P41279 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K8P41279 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K8P41279 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K8P41279 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K8P41279 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K8P41279 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms