Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HADHAP40939 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HADHAP40939 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HADHAP40939 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HADHAP40939 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HADHAP40939 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HADHAP40939 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HADHAP40939 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HADHAP40939 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HADHAP40939 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HADHAP40939 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HADHAP40939 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HADHAP40939 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HADHAP40939 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HADHAP40939 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HADHAP40939 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HADHAP40939 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HADHAP40939 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HADHAP40939 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HADHAP40939 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HADHAP40939 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HADHAP40939 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HADHAP40939 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HADHAP40939 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HADHAP40939 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HADHAP40939 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HADHAP40939 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HADHAP40939 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HADHAP40939 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HADHAP40939 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HADHAP40939 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HADHAP40939 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HADHAP40939 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHAP40939 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHAP40939 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHAP40939 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHAP40939 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHAP40939 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHAP40939 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHAP40939 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHAP40939 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HADHAP40939 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HADHAP40939 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HADHAP40939 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HADHAP40939 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HADHAP40939 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HADHAP40939 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HADHAP40939 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HADHAP40939 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HADHAP40939 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HADHAP40939 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HADHAP40939 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HADHAP40939 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HADHAP40939 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HADHAP40939 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HADHAP40939 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HADHAP40939 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HADHAP40939 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HADHAP40939 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HADHAP40939 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HADHAP40939 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHAP40939 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHAP40939 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHAP40939 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHAP40939 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHAP40939 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHAP40939 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHAP40939 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHAP40939 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHAP40939 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHAP40939 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHAP40939 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHAP40939 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HADHAP40939 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HADHAP40939 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHAP40939 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHAP40939 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHAP40939 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHAP40939 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHAP40939 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHAP40939 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHAP40939 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHAP40939 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHAP40939 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHAP40939 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHAP40939 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHAP40939 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHAP40939 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHAP40939 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHAP40939 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHAP40939 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HADHAP40939 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HADHAP40939 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HADHAP40939 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HADHAP40939 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HADHAP40939 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHAP40939 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHAP40939 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHAP40939 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHAP40939 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms