Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDH1P40925 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDH1P40925 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDH1P40925 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDH1P40925 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDH1P40925 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDH1P40925 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDH1P40925 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDH1P40925 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDH1P40925 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDH1P40925 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDH1P40925 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDH1P40925 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MDH1P40925 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MDH1P40925 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDH1P40925 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDH1P40925 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDH1P40925 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDH1P40925 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDH1P40925 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDH1P40925 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDH1P40925 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDH1P40925 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDH1P40925 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDH1P40925 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDH1P40925 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDH1P40925 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDH1P40925 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDH1P40925 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDH1P40925 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MDH1P40925 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDH1P40925 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDH1P40925 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDH1P40925 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDH1P40925 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDH1P40925 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDH1P40925 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDH1P40925 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDH1P40925 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDH1P40925 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDH1P40925 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDH1P40925 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDH1P40925 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDH1P40925 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDH1P40925 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDH1P40925 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDH1P40925 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDH1P40925 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDH1P40925 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDH1P40925 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDH1P40925 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDH1P40925 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDH1P40925 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDH1P40925 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDH1P40925 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDH1P40925 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDH1P40925 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDH1P40925 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDH1P40925 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDH1P40925 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDH1P40925 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDH1P40925 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDH1P40925 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDH1P40925 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDH1P40925 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDH1P40925 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDH1P40925 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDH1P40925 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MDH1P40925 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MDH1P40925 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MDH1P40925 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDH1P40925 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDH1P40925 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDH1P40925 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDH1P40925 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDH1P40925 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDH1P40925 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDH1P40925 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDH1P40925 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDH1P40925 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDH1P40925 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDH1P40925 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDH1P40925 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDH1P40925 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDH1P40925 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDH1P40925 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDH1P40925 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDH1P40925 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDH1P40925 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDH1P40925 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDH1P40925 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MDH1P40925 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDH1P40925 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDH1P40925 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDH1P40925 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDH1P40925 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDH1P40925 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDH1P40925 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDH1P40925 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDH1P40925 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms