Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PBX1P40424 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PBX1P40424 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PBX1P40424 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PBX1P40424 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PBX1P40424 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PBX1P40424 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PBX1P40424 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PBX1P40424 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PBX1P40424 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PBX1P40424 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PBX1P40424 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PBX1P40424 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PBX1P40424 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PBX1P40424 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PBX1P40424 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PBX1P40424 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PBX1P40424 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PBX1P40424 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PBX1P40424 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PBX1P40424 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PBX1P40424 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PBX1P40424 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PBX1P40424 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PBX1P40424 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PBX1P40424 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PBX1P40424 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PBX1P40424 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PBX1P40424 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PBX1P40424 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PBX1P40424 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PBX1P40424 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PBX1P40424 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PBX1P40424 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PBX1P40424 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PBX1P40424 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PBX1P40424 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PBX1P40424 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PBX1P40424 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PBX1P40424 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PBX1P40424 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PBX1P40424 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PBX1P40424 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PBX1P40424 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PBX1P40424 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PBX1P40424 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PBX1P40424 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PBX1P40424 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PBX1P40424 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PBX1P40424 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PBX1P40424 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PBX1P40424 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX1P40424 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX1P40424 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX1P40424 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX1P40424 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX1P40424 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX1P40424 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX1P40424 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PBX1P40424 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PBX1P40424 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PBX1P40424 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PBX1P40424 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PBX1P40424 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PBX1P40424 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PBX1P40424 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PBX1P40424 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PBX1P40424 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PBX1P40424 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PBX1P40424 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PBX1P40424 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PBX1P40424 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PBX1P40424 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PBX1P40424 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PBX1P40424 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PBX1P40424 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PBX1P40424 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX1P40424 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX1P40424 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX1P40424 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX1P40424 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX1P40424 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX1P40424 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX1P40424 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX1P40424 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX1P40424 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX1P40424 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX1P40424 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX1P40424 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX1P40424 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX1P40424 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX1P40424 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX1P40424 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX1P40424 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX1P40424 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PBX1P40424 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PBX1P40424 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PBX1P40424 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PBX1P40424 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PBX1P40424 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms