Protein–RNA interactions for Protein: P40227

CCT6A, T-complex protein 1 subunit zeta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT6AP40227 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCT6AP40227 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCT6AP40227 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCT6AP40227 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms