Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL4P36578 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL4P36578 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL4P36578 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL4P36578 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL4P36578 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL4P36578 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL4P36578 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL4P36578 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL4P36578 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPL4P36578 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL4P36578 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL4P36578 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL4P36578 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL4P36578 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL4P36578 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL4P36578 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL4P36578 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL4P36578 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL4P36578 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL4P36578 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL4P36578 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL4P36578 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL4P36578 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL4P36578 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL4P36578 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL4P36578 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL4P36578 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL4P36578 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL4P36578 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL4P36578 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL4P36578 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL4P36578 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL4P36578 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL4P36578 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL4P36578 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL4P36578 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL4P36578 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL4P36578 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL4P36578 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL4P36578 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL4P36578 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL4P36578 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL4P36578 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL4P36578 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL4P36578 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL4P36578 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL4P36578 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL4P36578 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL4P36578 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL4P36578 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL4P36578 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL4P36578 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL4P36578 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL4P36578 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL4P36578 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL4P36578 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL4P36578 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL4P36578 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL4P36578 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL4P36578 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL4P36578 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL4P36578 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL4P36578 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL4P36578 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL4P36578 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL4P36578 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL4P36578 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL4P36578 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL4P36578 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL4P36578 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL4P36578 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL4P36578 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL4P36578 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL4P36578 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL4P36578 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL4P36578 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL4P36578 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL4P36578 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL4P36578 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL4P36578 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL4P36578 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL4P36578 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL4P36578 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL4P36578 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL4P36578 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL4P36578 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL4P36578 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL4P36578 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL4P36578 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL4P36578 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL4P36578 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL4P36578 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL4P36578 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL4P36578 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL4P36578 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL4P36578 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL4P36578 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL4P36578 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL4P36578 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms