Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLCN1P35523 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLCN1P35523 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN1P35523 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLCN1P35523 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms