Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXN2P32314 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms