Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC8P31273 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXC8P31273 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC8P31273 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms