Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD40LGP29965 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD40LGP29965 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms