Protein–RNA interactions for Protein: P29350

PTPN6, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN6P29350 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN6P29350 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN6P29350 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms