Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBL1P28749 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBL1P28749 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBL1P28749 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBL1P28749 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBL1P28749 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBL1P28749 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBL1P28749 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBL1P28749 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBL1P28749 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBL1P28749 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBL1P28749 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RBL1P28749 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RBL1P28749 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBL1P28749 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBL1P28749 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBL1P28749 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBL1P28749 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBL1P28749 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBL1P28749 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBL1P28749 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBL1P28749 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBL1P28749 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBL1P28749 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBL1P28749 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBL1P28749 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBL1P28749 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBL1P28749 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBL1P28749 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBL1P28749 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBL1P28749 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBL1P28749 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBL1P28749 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBL1P28749 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBL1P28749 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL1P28749 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL1P28749 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL1P28749 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL1P28749 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL1P28749 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL1P28749 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL1P28749 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL1P28749 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL1P28749 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBL1P28749 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBL1P28749 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBL1P28749 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBL1P28749 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBL1P28749 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBL1P28749 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBL1P28749 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBL1P28749 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBL1P28749 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBL1P28749 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBL1P28749 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBL1P28749 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RBL1P28749 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBL1P28749 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBL1P28749 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBL1P28749 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBL1P28749 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBL1P28749 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBL1P28749 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RBL1P28749 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBL1P28749 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBL1P28749 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBL1P28749 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBL1P28749 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RBL1P28749 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBL1P28749 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RBL1P28749 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL1P28749 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL1P28749 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL1P28749 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL1P28749 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL1P28749 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL1P28749 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL1P28749 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL1P28749 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL1P28749 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL1P28749 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL1P28749 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL1P28749 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL1P28749 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL1P28749 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL1P28749 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL1P28749 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL1P28749 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL1P28749 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL1P28749 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL1P28749 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL1P28749 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL1P28749 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL1P28749 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL1P28749 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL1P28749 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL1P28749 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBL1P28749 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBL1P28749 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBL1P28749 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms