Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTFP26441 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTFP26441 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTFP26441 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTFP26441 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTFP26441 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTFP26441 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTFP26441 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTFP26441 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTFP26441 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTFP26441 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTFP26441 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTFP26441 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTFP26441 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTFP26441 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTFP26441 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTFP26441 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTFP26441 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTFP26441 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTFP26441 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTFP26441 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNTFP26441 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTFP26441 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTFP26441 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTFP26441 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTFP26441 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTFP26441 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTFP26441 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTFP26441 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTFP26441 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTFP26441 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTFP26441 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTFP26441 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTFP26441 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTFP26441 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTFP26441 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTFP26441 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTFP26441 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTFP26441 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTFP26441 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTFP26441 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTFP26441 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTFP26441 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTFP26441 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTFP26441 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTFP26441 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTFP26441 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTFP26441 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTFP26441 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTFP26441 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTFP26441 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTFP26441 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTFP26441 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTFP26441 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTFP26441 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTFP26441 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTFP26441 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTFP26441 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTFP26441 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTFP26441 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTFP26441 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTFP26441 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTFP26441 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTFP26441 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTFP26441 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTFP26441 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTFP26441 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTFP26441 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTFP26441 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTFP26441 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTFP26441 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTFP26441 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTFP26441 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTFP26441 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTFP26441 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTFP26441 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTFP26441 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTFP26441 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTFP26441 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTFP26441 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTFP26441 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTFP26441 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTFP26441 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTFP26441 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTFP26441 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTFP26441 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTFP26441 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTFP26441 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTFP26441 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTFP26441 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTFP26441 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTFP26441 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTFP26441 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTFP26441 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTFP26441 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTFP26441 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTFP26441 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTFP26441 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTFP26441 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTFP26441 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms