Protein–RNA interactions for Protein: P25440

BRD2, Bromodomain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD2P25440 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRD2P25440 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRD2P25440 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRD2P25440 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRD2P25440 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRD2P25440 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRD2P25440 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRD2P25440 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRD2P25440 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRD2P25440 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD2P25440 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD2P25440 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD2P25440 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD2P25440 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD2P25440 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD2P25440 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRD2P25440 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BRD2P25440 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRD2P25440 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRD2P25440 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BRD2P25440 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRD2P25440 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRD2P25440 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRD2P25440 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRD2P25440 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRD2P25440 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRD2P25440 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRD2P25440 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRD2P25440 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRD2P25440 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRD2P25440 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRD2P25440 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRD2P25440 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRD2P25440 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRD2P25440 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRD2P25440 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRD2P25440 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRD2P25440 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRD2P25440 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRD2P25440 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRD2P25440 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRD2P25440 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRD2P25440 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRD2P25440 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRD2P25440 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRD2P25440 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRD2P25440 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRD2P25440 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BRD2P25440 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRD2P25440 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRD2P25440 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRD2P25440 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRD2P25440 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRD2P25440 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRD2P25440 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRD2P25440 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRD2P25440 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRD2P25440 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRD2P25440 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRD2P25440 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRD2P25440 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRD2P25440 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRD2P25440 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRD2P25440 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BRD2P25440 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRD2P25440 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRD2P25440 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRD2P25440 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRD2P25440 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRD2P25440 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRD2P25440 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRD2P25440 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BRD2P25440 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRD2P25440 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BRD2P25440 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BRD2P25440 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRD2P25440 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRD2P25440 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRD2P25440 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRD2P25440 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRD2P25440 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRD2P25440 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRD2P25440 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRD2P25440 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRD2P25440 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRD2P25440 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRD2P25440 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRD2P25440 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRD2P25440 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRD2P25440 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRD2P25440 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRD2P25440 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRD2P25440 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRD2P25440 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRD2P25440 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRD2P25440 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRD2P25440 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRD2P25440 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRD2P25440 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRD2P25440 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms