Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR2AP24928 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2AP24928 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms