Protein–RNA interactions for Protein: P23759

PAX7, Paired box protein Pax-7, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX7P23759 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAX7P23759 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAX7P23759 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAX7P23759 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAX7P23759 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PAX7P23759 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PAX7P23759 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAX7P23759 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAX7P23759 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAX7P23759 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAX7P23759 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAX7P23759 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAX7P23759 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAX7P23759 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAX7P23759 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAX7P23759 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAX7P23759 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAX7P23759 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAX7P23759 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAX7P23759 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAX7P23759 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAX7P23759 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAX7P23759 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAX7P23759 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAX7P23759 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAX7P23759 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PAX7P23759 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAX7P23759 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAX7P23759 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAX7P23759 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAX7P23759 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAX7P23759 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAX7P23759 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PAX7P23759 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAX7P23759 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAX7P23759 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAX7P23759 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAX7P23759 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAX7P23759 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAX7P23759 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAX7P23759 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAX7P23759 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAX7P23759 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAX7P23759 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAX7P23759 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAX7P23759 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAX7P23759 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAX7P23759 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAX7P23759 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAX7P23759 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAX7P23759 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAX7P23759 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAX7P23759 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAX7P23759 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAX7P23759 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAX7P23759 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PAX7P23759 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAX7P23759 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAX7P23759 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAX7P23759 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAX7P23759 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAX7P23759 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAX7P23759 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAX7P23759 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
PAX7P23759 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAX7P23759 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAX7P23759 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAX7P23759 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAX7P23759 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAX7P23759 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAX7P23759 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAX7P23759 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAX7P23759 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAX7P23759 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAX7P23759 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAX7P23759 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAX7P23759 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PAX7P23759 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAX7P23759 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAX7P23759 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAX7P23759 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAX7P23759 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAX7P23759 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAX7P23759 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAX7P23759 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAX7P23759 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAX7P23759 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAX7P23759 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAX7P23759 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAX7P23759 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAX7P23759 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAX7P23759 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAX7P23759 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAX7P23759 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PAX7P23759 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAX7P23759 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAX7P23759 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PAX7P23759 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAX7P23759 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAX7P23759 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms