Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYF6P23409 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYF6P23409 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYF6P23409 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYF6P23409 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYF6P23409 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYF6P23409 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYF6P23409 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYF6P23409 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYF6P23409 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYF6P23409 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYF6P23409 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYF6P23409 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYF6P23409 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYF6P23409 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYF6P23409 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYF6P23409 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYF6P23409 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYF6P23409 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MYF6P23409 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF6P23409 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF6P23409 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF6P23409 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF6P23409 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF6P23409 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF6P23409 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF6P23409 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYF6P23409 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYF6P23409 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYF6P23409 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MYF6P23409 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYF6P23409 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYF6P23409 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYF6P23409 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYF6P23409 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYF6P23409 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYF6P23409 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYF6P23409 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYF6P23409 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYF6P23409 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYF6P23409 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYF6P23409 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYF6P23409 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYF6P23409 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYF6P23409 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYF6P23409 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYF6P23409 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYF6P23409 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYF6P23409 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYF6P23409 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYF6P23409 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYF6P23409 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYF6P23409 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYF6P23409 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYF6P23409 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYF6P23409 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYF6P23409 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYF6P23409 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYF6P23409 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYF6P23409 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYF6P23409 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYF6P23409 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYF6P23409 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYF6P23409 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYF6P23409 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYF6P23409 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYF6P23409 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYF6P23409 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYF6P23409 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYF6P23409 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYF6P23409 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYF6P23409 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYF6P23409 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYF6P23409 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYF6P23409 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYF6P23409 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYF6P23409 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYF6P23409 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYF6P23409 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYF6P23409 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYF6P23409 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYF6P23409 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYF6P23409 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYF6P23409 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYF6P23409 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYF6P23409 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYF6P23409 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYF6P23409 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYF6P23409 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYF6P23409 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYF6P23409 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYF6P23409 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYF6P23409 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYF6P23409 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYF6P23409 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYF6P23409 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYF6P23409 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYF6P23409 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYF6P23409 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYF6P23409 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms