Protein–RNA interactions for Protein: P22894

MMP8, Neutrophil collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP8P22894 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP8P22894 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP8P22894 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP8P22894 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP8P22894 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP8P22894 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP8P22894 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP8P22894 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP8P22894 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP8P22894 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP8P22894 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP8P22894 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP8P22894 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP8P22894 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP8P22894 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP8P22894 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP8P22894 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP8P22894 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP8P22894 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP8P22894 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP8P22894 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP8P22894 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP8P22894 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP8P22894 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP8P22894 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP8P22894 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP8P22894 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP8P22894 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP8P22894 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP8P22894 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP8P22894 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP8P22894 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP8P22894 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP8P22894 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP8P22894 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MMP8P22894 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP8P22894 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP8P22894 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP8P22894 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP8P22894 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP8P22894 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP8P22894 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP8P22894 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP8P22894 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP8P22894 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP8P22894 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP8P22894 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP8P22894 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP8P22894 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP8P22894 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP8P22894 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP8P22894 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP8P22894 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP8P22894 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP8P22894 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP8P22894 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP8P22894 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP8P22894 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP8P22894 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP8P22894 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP8P22894 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP8P22894 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP8P22894 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP8P22894 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP8P22894 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP8P22894 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP8P22894 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP8P22894 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP8P22894 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP8P22894 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP8P22894 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP8P22894 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP8P22894 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP8P22894 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP8P22894 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP8P22894 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP8P22894 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP8P22894 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP8P22894 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP8P22894 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP8P22894 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP8P22894 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP8P22894 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP8P22894 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP8P22894 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP8P22894 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP8P22894 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP8P22894 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP8P22894 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP8P22894 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP8P22894 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP8P22894 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP8P22894 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP8P22894 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP8P22894 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP8P22894 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP8P22894 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP8P22894 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP8P22894 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP8P22894 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms