Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPD1P21695 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPD1P21695 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GPD1P21695 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPD1P21695 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPD1P21695 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GPD1P21695 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPD1P21695 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPD1P21695 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPD1P21695 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPD1P21695 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPD1P21695 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPD1P21695 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPD1P21695 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPD1P21695 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPD1P21695 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPD1P21695 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPD1P21695 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPD1P21695 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPD1P21695 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPD1P21695 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPD1P21695 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPD1P21695 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPD1P21695 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPD1P21695 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPD1P21695 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPD1P21695 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPD1P21695 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPD1P21695 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPD1P21695 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPD1P21695 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPD1P21695 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPD1P21695 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPD1P21695 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPD1P21695 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPD1P21695 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPD1P21695 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPD1P21695 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPD1P21695 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GPD1P21695 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPD1P21695 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPD1P21695 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPD1P21695 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPD1P21695 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GPD1P21695 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPD1P21695 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPD1P21695 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GPD1P21695 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPD1P21695 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPD1P21695 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPD1P21695 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPD1P21695 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPD1P21695 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPD1P21695 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPD1P21695 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPD1P21695 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPD1P21695 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPD1P21695 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPD1P21695 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPD1P21695 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPD1P21695 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPD1P21695 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPD1P21695 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPD1P21695 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPD1P21695 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPD1P21695 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPD1P21695 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPD1P21695 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPD1P21695 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPD1P21695 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPD1P21695 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPD1P21695 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPD1P21695 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPD1P21695 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPD1P21695 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPD1P21695 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPD1P21695 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GPD1P21695 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPD1P21695 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPD1P21695 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GPD1P21695 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPD1P21695 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPD1P21695 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPD1P21695 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPD1P21695 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPD1P21695 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPD1P21695 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPD1P21695 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPD1P21695 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPD1P21695 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPD1P21695 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GPD1P21695 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPD1P21695 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPD1P21695 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPD1P21695 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPD1P21695 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPD1P21695 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPD1P21695 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GPD1P21695 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPD1P21695 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms