Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTNP21246 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTNP21246 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTNP21246 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTNP21246 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTNP21246 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTNP21246 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTNP21246 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTNP21246 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTNP21246 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTNP21246 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTNP21246 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTNP21246 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTNP21246 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTNP21246 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTNP21246 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTNP21246 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTNP21246 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTNP21246 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTNP21246 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTNP21246 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTNP21246 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTNP21246 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTNP21246 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTNP21246 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTNP21246 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTNP21246 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTNP21246 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTNP21246 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTNP21246 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTNP21246 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTNP21246 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTNP21246 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTNP21246 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTNP21246 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTNP21246 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTNP21246 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTNP21246 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTNP21246 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTNP21246 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTNP21246 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTNP21246 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTNP21246 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTNP21246 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTNP21246 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTNP21246 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTNP21246 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTNP21246 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTNP21246 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTNP21246 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTNP21246 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTNP21246 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTNP21246 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTNP21246 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTNP21246 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTNP21246 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTNP21246 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTNP21246 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTNP21246 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTNP21246 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTNP21246 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTNP21246 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTNP21246 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTNP21246 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTNP21246 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTNP21246 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTNP21246 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTNP21246 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTNP21246 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTNP21246 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTNP21246 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTNP21246 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTNP21246 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTNP21246 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTNP21246 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTNP21246 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTNP21246 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTNP21246 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTNP21246 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTNP21246 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTNP21246 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTNP21246 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTNP21246 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTNP21246 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTNP21246 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTNP21246 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTNP21246 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTNP21246 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTNP21246 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTNP21246 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTNP21246 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTNP21246 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTNP21246 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTNP21246 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTNP21246 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTNP21246 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTNP21246 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTNP21246 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTNP21246 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTNP21246 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms