Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM21P19474 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM21P19474 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms