Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GM2AP17900 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GM2AP17900 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GM2AP17900 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GM2AP17900 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GM2AP17900 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GM2AP17900 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GM2AP17900 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GM2AP17900 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GM2AP17900 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GM2AP17900 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GM2AP17900 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GM2AP17900 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GM2AP17900 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GM2AP17900 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GM2AP17900 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GM2AP17900 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GM2AP17900 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GM2AP17900 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GM2AP17900 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GM2AP17900 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GM2AP17900 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GM2AP17900 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GM2AP17900 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GM2AP17900 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GM2AP17900 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GM2AP17900 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GM2AP17900 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GM2AP17900 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GM2AP17900 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GM2AP17900 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GM2AP17900 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GM2AP17900 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GM2AP17900 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GM2AP17900 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GM2AP17900 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GM2AP17900 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GM2AP17900 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GM2AP17900 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GM2AP17900 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GM2AP17900 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GM2AP17900 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GM2AP17900 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GM2AP17900 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GM2AP17900 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GM2AP17900 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GM2AP17900 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GM2AP17900 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GM2AP17900 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GM2AP17900 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GM2AP17900 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GM2AP17900 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GM2AP17900 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GM2AP17900 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GM2AP17900 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GM2AP17900 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GM2AP17900 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GM2AP17900 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GM2AP17900 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GM2AP17900 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GM2AP17900 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GM2AP17900 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GM2AP17900 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GM2AP17900 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GM2AP17900 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GM2AP17900 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GM2AP17900 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GM2AP17900 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GM2AP17900 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GM2AP17900 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GM2AP17900 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GM2AP17900 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GM2AP17900 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GM2AP17900 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GM2AP17900 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GM2AP17900 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GM2AP17900 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GM2AP17900 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GM2AP17900 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GM2AP17900 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GM2AP17900 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GM2AP17900 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GM2AP17900 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GM2AP17900 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GM2AP17900 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GM2AP17900 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GM2AP17900 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GM2AP17900 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GM2AP17900 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GM2AP17900 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GM2AP17900 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GM2AP17900 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GM2AP17900 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GM2AP17900 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GM2AP17900 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GM2AP17900 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GM2AP17900 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GM2AP17900 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GM2AP17900 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GM2AP17900 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms