Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DESP17661 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DESP17661 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DESP17661 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DESP17661 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DESP17661 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DESP17661 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DESP17661 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DESP17661 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DESP17661 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DESP17661 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DESP17661 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DESP17661 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DESP17661 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DESP17661 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DESP17661 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DESP17661 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DESP17661 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DESP17661 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DESP17661 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DESP17661 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DESP17661 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DESP17661 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DESP17661 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DESP17661 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DESP17661 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DESP17661 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DESP17661 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DESP17661 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DESP17661 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DESP17661 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DESP17661 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DESP17661 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DESP17661 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DESP17661 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DESP17661 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DESP17661 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DESP17661 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DESP17661 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DESP17661 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DESP17661 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DESP17661 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DESP17661 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DESP17661 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DESP17661 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DESP17661 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DESP17661 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DESP17661 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DESP17661 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DESP17661 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DESP17661 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DESP17661 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DESP17661 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DESP17661 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DESP17661 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DESP17661 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DESP17661 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DESP17661 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DESP17661 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DESP17661 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DESP17661 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DESP17661 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DESP17661 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DESP17661 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DESP17661 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DESP17661 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DESP17661 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DESP17661 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DESP17661 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DESP17661 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DESP17661 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DESP17661 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DESP17661 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DESP17661 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DESP17661 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DESP17661 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DESP17661 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DESP17661 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DESP17661 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DESP17661 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DESP17661 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DESP17661 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DESP17661 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DESP17661 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DESP17661 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DESP17661 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DESP17661 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DESP17661 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DESP17661 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DESP17661 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DESP17661 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DESP17661 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DESP17661 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DESP17661 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DESP17661 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DESP17661 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DESP17661 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DESP17661 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DESP17661 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DESP17661 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms